EUBAKTERIJA (engl. eubacteria, eubacterium), jedna od dve velike grupe bakterija koja je izdvojena na osnovu filogenskih karakteristika prokariotskih organizama. Drugu grupu čine Archaebacteriae. Grupa Eubakterija obuhvata: Gram-negativne Eubakterije sa ćelijskim zidom, Gram-pozitivne sa ćelijskim zidom i Eubakterije bez ćelijskog zida. Takođe, naziv Eubakterija označava i rod anaerobnih, pleomorfnih, nepokretnih Gram- -pozitivnih bakterija koje se najčešće otkrivaju kod mešovitih infekcija orofaringealne ili crevne flore. Obuhvata nekoliko vrsta od kojih je najznačajnija Eubacterium foedans