Primarna amenoreja uterusnog porekla sreće se kod neosteljivosti materice, u prvom redu endometrijuma, na normalne hormonske podsticaje jajnika ili kod urođene aplazije materice.
Primarna amenoreia uterusnog porekla srece se kod neosteljivosti materice, u prvom redu endometrijuma, na normalne hormonske podsticaje jajnika ili kod urođene aplazije materice. Isto tako, amenoreia ovog tipa viđa se kod hipoplazije materice veceg stepena. Sekundarna amenoreja materičnog porekla nastaje kod oštecenja sluzokože materice kaustičnim sredstvima ili radijumom posle Čega dolazi do srastanja njenih zidova i obliteracije lumena, kao i kod uznapredovalog endometritisa tuberkulozne etiologije (Netterove priraslice). Osim toga, ovaj tip amenoreje sreće sekao posledica grubih kiretaža posle porođaja ili pobačaja, ako se pritom odstrane i bazalni delovi endometrijuma, koje mogu da dovedu do stvaranja atrofične, funkcionalno manje vredne sluzokože materice, ili, pak, kada se u materičnoj šupljini stvore manje ili veće srasline koje delimično ili potpuno obliterišu materičnu duplju (Ašermanov sindrom). Do slične situacije, mada izuzetno retko, može da dovede i intrauterina infekcija u toku porođaja ili pobačaja. Ponekad je i kod normalno razvijene materice prag osetljivosti endometrijuma toliko povišen da ne reaguje na uobičajene hormonske impulse, što se ispoljava amenorejom.